无机成分大量存在于矿物和介壳类药物中，在植物药中也含有一些无机盐类，如钾、钙、镁盐等，他们大多与组织细胞中的有机酸结合而成盐共存。
　　矿物类药物通常采用煅烧或煅红醋淬的方法，除了可改变其物理性状，使之易于粉碎，有利于有效成分的煎出外，也有利于药物在胃肠道的吸收，从而增强疗效，如磁石、自然铜、牡蛎等。某些含结晶水的矿物，经煅制后，失去结晶水而改变药效，如石膏、明矾、寒水石等。在加热炮制过程中，可改变某些药物的化学成分，产生治疗作用，如炉甘石原来的主要成分为碳酸锌（ZnCO3），煅后变为氧化锌（ZnO），具有解毒、明目退翳、收湿止痒、敛疮的作用。
炮制过程中，水处理时间过长，易使所含水溶性无机盐类成分流失而降低疗效。如夏枯草中含有大量钾盐，若经长时间的水处理，会大大降低其降血压、利尿作用。
　　目前对微量元素的研究也受到重视，因微量元素是人体健康不可缺少的物质。先已查明，生命活动中必须的微量元素有16种，与人体密切相关的有25种。例如锌，集中于人体的精液中，缺乏锌，人就长不高，并失去生殖能力。缺乏锰，会造成显著的智力低下和不育。缺乏铜，会造成软骨病，发育不良，关节变形，皮肤出现块块白斑，甚至全身变白。硒可促进机体免疫力，缺乏硒等引起高发癌症。锂可间接控制体内儿茶酚胺的合成，调节中枢神经等。他们一般对热稳定，炮制破坏了其他有机成分，使这些微量元素更易溶出，有利于疗效的发挥。